MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Agrobacterium vitis S4 plasmid pAtS4c

Total Repeats: 4242

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011984	GCG	2	6	26644	26649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083167
502	NC_011984	GCT	2	6	26662	26667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083167
503	NC_011984	CTTC	2	8	26672	26679	0 %	50 %	0 %	50 %	222083167
504	NC_011984	C	6	6	26725	26730	0 %	0 %	0 %	100 %	222083167
505	NC_011984	CAT	2	6	26777	26782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222083167
506	NC_011984	GGC	2	6	26783	26788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083167
507	NC_011984	GCG	2	6	26848	26853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083167
508	NC_011984	ATC	2	6	26862	26867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222083167
509	NC_011984	CAG	2	6	27047	27052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083167
510	NC_011984	GCG	2	6	27082	27087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083167
511	NC_011984	GCCTG	2	10	27164	27173	0 %	20 %	40 %	40 %	222083167
512	NC_011984	CGA	2	6	27182	27187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083167
513	NC_011984	TC	3	6	27188	27193	0 %	50 %	0 %	50 %	222083167
514	NC_011984	GGC	2	6	27261	27266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083167
515	NC_011984	CAC	2	6	27345	27350	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222083167
516	NC_011984	CGG	2	6	27353	27358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083167
517	NC_011984	GAA	2	6	27360	27365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222083167
518	NC_011984	CGGT	2	8	27439	27446	0 %	25 %	50 %	25 %	222083167
519	NC_011984	CGA	2	6	27464	27469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083167
520	NC_011984	CGG	2	6	27553	27558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083167
521	NC_011984	CG	3	6	27612	27617	0 %	0 %	50 %	50 %	222083167
522	NC_011984	AAGC	2	8	27630	27637	50 %	0 %	25 %	25 %	222083167
523	NC_011984	AAG	2	6	27642	27647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222083167
524	NC_011984	ATC	2	6	27648	27653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222083167
525	NC_011984	CGC	2	6	27716	27721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083167
526	NC_011984	CCG	2	6	27751	27756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083167
527	NC_011984	GCT	2	6	27779	27784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083167
528	NC_011984	CGT	2	6	27801	27806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083167
529	NC_011984	GCCG	2	8	27828	27835	0 %	0 %	50 %	50 %	222083167
530	NC_011984	GAG	2	6	27852	27857	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222083167
531	NC_011984	TCT	2	6	27886	27891	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222083167
532	NC_011984	AG	4	8	27933	27940	50 %	0 %	50 %	0 %	222083167
533	NC_011984	GAC	2	6	27963	27968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083167
534	NC_011984	CTG	2	6	27970	27975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083167
535	NC_011984	CGGC	2	8	28011	28018	0 %	0 %	50 %	50 %	222083167
536	NC_011984	GGA	2	6	28070	28075	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222083167
537	NC_011984	CGC	2	6	28161	28166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083167
538	NC_011984	GC	3	6	28165	28170	0 %	0 %	50 %	50 %	222083167
539	NC_011984	TCGA	2	8	28204	28211	25 %	25 %	25 %	25 %	222083167
540	NC_011984	CCGT	2	8	28230	28237	0 %	25 %	25 %	50 %	222083167
541	NC_011984	AACAG	2	10	28378	28387	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
542	NC_011984	GAC	2	6	28494	28499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_011984	CGC	2	6	28543	28548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
544	NC_011984	GGC	2	6	28642	28647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083168
545	NC_011984	GAT	2	6	28701	28706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222083168
546	NC_011984	TGGA	2	8	28710	28717	25 %	25 %	50 %	0 %	222083168
547	NC_011984	TGA	2	6	28835	28840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222083168
548	NC_011984	GCGA	2	8	28872	28879	25 %	0 %	50 %	25 %	222083168
549	NC_011984	CGC	2	6	28909	28914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083168
550	NC_011984	GCC	2	6	28997	29002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083168
551	NC_011984	CGG	2	6	29012	29017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083168
552	NC_011984	GC	3	6	29060	29065	0 %	0 %	50 %	50 %	222083168
553	NC_011984	TGA	2	6	29094	29099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222083168
554	NC_011984	TCG	2	6	29105	29110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083168
555	NC_011984	GCCG	2	8	29169	29176	0 %	0 %	50 %	50 %	222083168
556	NC_011984	GA	3	6	29208	29213	50 %	0 %	50 %	0 %	222083168
557	NC_011984	CAGC	2	8	29229	29236	25 %	0 %	25 %	50 %	222083168
558	NC_011984	CGA	2	6	29321	29326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083168
559	NC_011984	GAG	2	6	29428	29433	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
560	NC_011984	AGCGG	2	10	29457	29466	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
561	NC_011984	GAC	2	6	29523	29528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083169
562	NC_011984	TCG	2	6	29572	29577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083169
563	NC_011984	CGT	2	6	29580	29585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083169
564	NC_011984	GC	3	6	29632	29637	0 %	0 %	50 %	50 %	222083169
565	NC_011984	GCG	2	6	29680	29685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083169
566	NC_011984	TTC	2	6	29724	29729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222083169
567	NC_011984	TCG	2	6	29746	29751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083169
568	NC_011984	ATCGC	2	10	29764	29773	20 %	20 %	20 %	40 %	222083169
569	NC_011984	CTT	2	6	29790	29795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222083169
570	NC_011984	GAT	2	6	29799	29804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222083169
571	NC_011984	GCT	2	6	29876	29881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083169
572	NC_011984	TCG	2	6	29971	29976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083169
573	NC_011984	ATG	2	6	29998	30003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222083169
574	NC_011984	ATG	2	6	30013	30018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
575	NC_011984	A	6	6	30024	30029	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_011984	GGC	2	6	30135	30140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083170
577	NC_011984	CGG	2	6	30377	30382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083170
578	NC_011984	GCA	2	6	30400	30405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083170
579	NC_011984	GCC	2	6	30429	30434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083170
580	NC_011984	CTG	2	6	30450	30455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083170
581	NC_011984	GCT	2	6	30499	30504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083170
582	NC_011984	CGT	2	6	30522	30527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083170
583	NC_011984	CGC	2	6	30536	30541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083170
584	NC_011984	CCG	2	6	30571	30576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083170
585	NC_011984	GGT	2	6	30594	30599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222083170
586	NC_011984	GGT	2	6	30636	30641	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222083170
587	NC_011984	GCC	2	6	30654	30659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083170
588	NC_011984	CGA	2	6	30707	30712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083170
589	NC_011984	AGG	2	6	30713	30718	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222083170
590	NC_011984	CCG	2	6	30748	30753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083170
591	NC_011984	AGG	2	6	30829	30834	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222083170
592	NC_011984	GAA	2	6	30839	30844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222083170
593	NC_011984	CGA	2	6	30860	30865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083170
594	NC_011984	CG	3	6	30944	30949	0 %	0 %	50 %	50 %	222083170
595	NC_011984	TGG	2	6	30977	30982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222083170
596	NC_011984	CCA	2	6	31012	31017	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222083171
597	NC_011984	GTC	2	6	31030	31035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083171
598	NC_011984	CG	3	6	31055	31060	0 %	0 %	50 %	50 %	222083171
599	NC_011984	CCG	2	6	31092	31097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083171
600	NC_011984	CGC	2	6	31229	31234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083171
601	NC_011984	CG	3	6	31332	31337	0 %	0 %	50 %	50 %	222083171
602	NC_011984	GC	3	6	31365	31370	0 %	0 %	50 %	50 %	222083171
603	NC_011984	GGC	2	6	31398	31403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083171
604	NC_011984	GGC	2	6	31421	31426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083171
605	NC_011984	CCAT	2	8	31437	31444	25 %	25 %	0 %	50 %	222083171
606	NC_011984	GCA	3	9	31495	31503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083171
607	NC_011984	CAC	2	6	31762	31767	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
608	NC_011984	TTC	2	6	31783	31788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_011984	CTG	2	6	32119	32124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083172
610	NC_011984	GCG	2	6	32177	32182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083172
611	NC_011984	GGA	2	6	32244	32249	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222083172
612	NC_011984	CGGG	2	8	32250	32257	0 %	0 %	75 %	25 %	222083172
613	NC_011984	GGC	2	6	32307	32312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083172
614	NC_011984	TTC	2	6	32338	32343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222083172
615	NC_011984	CG	3	6	32365	32370	0 %	0 %	50 %	50 %	222083172
616	NC_011984	TCTGC	2	10	32373	32382	0 %	40 %	20 %	40 %	222083172
617	NC_011984	TGA	2	6	32434	32439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222083172
618	NC_011984	CAC	2	6	32457	32462	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
619	NC_011984	GAC	2	6	32479	32484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_011984	TCG	2	6	32553	32558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_011984	GCGCC	2	10	32602	32611	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
622	NC_011984	CGAGGC	2	12	32718	32729	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	222083173
623	NC_011984	GGGC	2	8	32777	32784	0 %	0 %	75 %	25 %	222083173
624	NC_011984	TAC	2	6	32827	32832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222083173
625	NC_011984	CGG	2	6	32879	32884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083173
626	NC_011984	CAT	2	6	32906	32911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_011984	A	6	6	33016	33021	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_011984	GCAGC	2	10	33027	33036	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
629	NC_011984	TCG	3	9	33202	33210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083174
630	NC_011984	AGC	3	9	33307	33315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083174
631	NC_011984	GC	3	6	33314	33319	0 %	0 %	50 %	50 %	222083174
632	NC_011984	GAT	2	6	33401	33406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222083174
633	NC_011984	TCA	2	6	33451	33456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222083174
634	NC_011984	CGG	2	6	33521	33526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083174
635	NC_011984	CCG	2	6	33603	33608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083174
636	NC_011984	GCC	2	6	33665	33670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083174
637	NC_011984	TCTG	2	8	33675	33682	0 %	50 %	25 %	25 %	222083174
638	NC_011984	GCAT	2	8	33748	33755	25 %	25 %	25 %	25 %	222083174
639	NC_011984	TCA	2	6	33853	33858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222083174
640	NC_011984	CGA	2	6	33949	33954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083174
641	NC_011984	CGA	2	6	33983	33988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083174
642	NC_011984	CGC	2	6	33998	34003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083174
643	NC_011984	ACG	2	6	34036	34041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083174
644	NC_011984	ACG	2	6	34153	34158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083174
645	NC_011984	CGC	2	6	34166	34171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222083174
646	NC_011984	GT	3	6	34202	34207	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
647	NC_011984	GAG	2	6	34266	34271	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
648	NC_011984	TCA	2	6	34298	34303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
649	NC_011984	GCT	2	6	34337	34342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
650	NC_011984	GCT	2	6	34388	34393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
651	NC_011984	CGA	2	6	34438	34443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083175
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653	NC_011984	CAA	2	6	34631	34636	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222083175
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656	NC_011984	TCT	2	6	34742	34747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222083175
657	NC_011984	GAC	2	6	34792	34797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083175
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659	NC_011984	GCA	2	6	35007	35012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083175
660	NC_011984	GCG	2	6	35016	35021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083175
661	NC_011984	GCG	2	6	35157	35162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083175
662	NC_011984	CATGCC	2	12	35401	35412	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
663	NC_011984	CTA	2	6	35418	35423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
664	NC_011984	G	6	6	35521	35526	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
665	NC_011984	GCT	2	6	35552	35557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
666	NC_011984	A	8	8	35565	35572	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
667	NC_011984	ATA	2	6	35617	35622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
668	NC_011984	AAGC	2	8	35628	35635	50 %	0 %	25 %	25 %	222083176
669	NC_011984	CG	3	6	35693	35698	0 %	0 %	50 %	50 %	222083176
670	NC_011984	AGA	2	6	35807	35812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222083176
671	NC_011984	TGG	2	6	35847	35852	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222083176
672	NC_011984	CCAG	2	8	35914	35921	25 %	0 %	25 %	50 %	222083176
673	NC_011984	ATC	2	6	35959	35964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222083176
674	NC_011984	CAT	2	6	36097	36102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222083176
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682	NC_011984	TCG	2	6	36530	36535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222083176
683	NC_011984	CAG	2	6	36544	36549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083176
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687	NC_011984	CGG	2	6	36685	36690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083176
688	NC_011984	CTC	2	6	36806	36811	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222083176
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693	NC_011984	GCTC	2	8	37080	37087	0 %	25 %	25 %	50 %	222083177
694	NC_011984	CGG	3	9	37113	37121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083177
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699	NC_011984	CGG	2	6	37706	37711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083178
700	NC_011984	AAAGC	2	10	37742	37751	60 %	0 %	20 %	20 %	222083178
701	NC_011984	GC	4	8	37767	37774	0 %	0 %	50 %	50 %	222083178
702	NC_011984	AACG	2	8	37808	37815	50 %	0 %	25 %	25 %	222083178
703	NC_011984	CCA	2	6	37888	37893	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222083178
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708	NC_011984	CGA	2	6	38226	38231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083178
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741	NC_011984	CG	3	6	39836	39841	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
742	NC_011984	TGC	2	6	39845	39850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
743	NC_011984	ATCG	2	8	39915	39922	25 %	25 %	25 %	25 %	222083179
744	NC_011984	CAG	2	6	39970	39975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222083179
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753	NC_011984	TC	3	6	40340	40345	0 %	50 %	0 %	50 %	222083179
754	NC_011984	CGG	2	6	40445	40450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222083179
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757	NC_011984	TCT	2	6	40582	40587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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